AG25.秘密之池！好多水跃鱼 （小刚收服水跃鱼）
AG26.长鼻叶族的袭击
AG27.火岩队对抗水舰队，秘密基地的战斗！T
AG28.狩猎凤蝶与毒粉蝶！进化之后！ （小遥的甲壳蛹进化成狩猎凤蝶，武藏的盾甲茧进化成毒粉蝶）
AG29.勾魂眼的惊奇
AG30.格斗少女与玛沙那！暴风雨之中!
AG31.再战武斗道馆！乘浪的战斗场地！（小智得到拳击徽章）
电气系道馆（32~40）
AG32.废弃之船！悄悄靠近的影子
AG33.小遥的劲敌！特训！神奇宝贝华丽大赛！S
AG34.最初拿到的神奇宝贝，大混乱!
AG35.小遥！初次挑战神奇宝贝华丽大赛！S
AG36.保护海之博物馆，火岩队的袭击！T
AG37.美女与野兽?狡猾天狗和乔伊小姐
AG38.正电拍拍和负电拍拍！山上的灯塔!
AG39.唱歌！神奇宝贝戏法屋！
AG40.紫堇道馆！铁旋的电击战斗！（小智得到电力徽章）
火炎系道馆（41~56）
AG41.木守宫的新绝招！西瓜园的种子机枪（小智的木守宫学会种子机关枪）
AG42.电萤虫与甜甜莹！爱的舞蹈!
AG43.飞吧宝贝龙！迎向明天！
AG44.小霞登场！波克比和梦幻王国！（小霞归队）X
AG45.海市蜃楼的那边 波克比的乐园！（小霞的波克比进化成波克基古；波克基古离开小霞；小霞离队）X
AG46.战斗家庭！4比4！
AG47.向尾喵和芳香治疗 （小遥收服向尾喵）
AG48.猫鼬斩VS饭匙蛇！ 劲敌对决
AG49.小胜VS胜人！守护溜溜糖球！
AG50.神奇宝贝华丽大赛 秋叶大会！S
AG51.VS恰雷姆，华丽对战（小遥得到缎带）S
AG52.正电拍拍和负电拍拍，应援之道
AG53.向尾喵和协助 呆火驼牧场
AG54.再次遇见火岩队&水舰队！烟突山作战！T
AG55.新人道馆训练家亚莎 满地坑洞的战斗场地
AG56.热血徽章！在燃烧的战斗中得到它！（小智得到烈焰徽章）
一般系道馆（57~70）
AG57.好多晃晃斑！找寻山另外一边的幸福
AG58.闯越钢之谷！煤炭龟VS大钢蛇 （小智收服煤炭龟）
AG59.紫堇道馆再度VS 雷电兽！
AG60.向尾喵与优雅猫！传说中的协调训练家登场！（小遥的向尾喵学会暴风雪）
AG61.戴面具的协调训练家，假面使者登场！！S
AG62.绿茵镇 神奇宝贝华丽大赛！（小遥得到缎带）S
AG63.太阳岩和莲帽小童！神圣森林的传说！（小刚的莲叶童子进化成莲帽小童）
AG64.青绵鸟的天空！小遥的心！
AG65.溶食兽击退大作战！
AG66.一触即发！爆音怪VS森林蜥蜴 （小智木守宫进化成森林蜥蜴）
AG67.跳舞战斗！乐天河童！
AG68.爸爸是偶像！？冒牌的道馆训练家！
AG69.橙华道馆的危机！家庭危机！
AG70.橙华道馆战！第五个徽章！ （小智得到天秤徽章）
飞行系道馆（71~85）
AG71.大木博士和小田卷博士！秘密基地之战！
AG72.双人合作赛，小智对抗小遥！？
AG73.禁忌森林的国王 妙蛙花！（小遥得到妙蛙种子）
AG74.妙蛙种子和妙蛙种子！夺回宝贝球！（小智的妙蛙种子归队本集结束后离队）
AG75.对决！巨大鲶鱼王和钓鱼高手
AG76.天秤偶和雾中的遗迹！
AG77.强敌！？妈妈级协调训练家登场！S
AG78.神奇宝贝华丽大赛 长寿大会！S
AG79.跳跳猪在找的东西！？
AG80.首度挑战！空中竞技 神奇圆环！（小智傲骨燕进化成大王燕）
AG81.怨影娃娃的大宅！
AG82.森林格斗王！？力壮鸡VS斗笠菇（小遥的火稚鸡进化成力壮鸡）
AG83.天气研究所的漂浮泡泡！T
AG84.茵郁市的羽翼嘉年华会！（小次郎得到风铃铃）
AG85.茵郁道馆！天空之战！（小智得到白羽徽章）
超能力系道馆（86~100）
AG86.喷火驼载着电影来！
AG87.神秘！从宇宙来的神奇宝贝！？
AG88.香蕉懒人翁园的卡比兽！
AG89.皮卡丘加入火箭队！？
AG90.抵达水静市！能量方块和回转攻！
AG91.神奇宝贝华丽大赛 水静大会！ （小遥得到缎带）
AG92.那三只登场，裁判学校之岛！
AG93.珍珠贝和跳跳猪！寻找珍珠！
AG94.古空棘鱼与深海的秘宝！
AG95.猎斑鱼与樱花鱼！进化之谜！
AG96.肌肉对战！？双打比赛！
AG97.固拉多VS盖欧卡！（前篇）T
AG98.固拉多VS盖欧卡！（后篇）T
AG99.枫和南！宇宙中心的战斗！
AG100.绿岭道馆！太阳岩与月石！（小智得到心灵徽章）
水系道馆（101~111）
AG101.大海男儿！四天王源治登场！
AG102.诸星博士之岛！化石神奇宝贝出现！（小遥的妙蛙种子学会花之舞）
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